Säkerhetsstyrkor har platsen under kontroll och de skadade har förts till närliggande sjukhusinrättningar, enligt militärens talesperson Antony Mualushayi.
Detaljerna är oklara, både vad gäller antalet offer och vem eller vilka som kan ligga bakom attacken. Över 25 personer uppges ha skadats, enligt lokala myndigheter.
Enligt Mualushayi har en misstänkt, en kenyan, gripits. Landets kommunikationsdepartement uppger på sociala medier att attacken uppenbarligen utfördes av gruppen ADF (Allierade demokratiska styrkorna).
Den islamistiska rebellgruppen ADF, som har misstänkta kopplingar till terrorgruppen IS, är aktiv i Norra Kivu-provinsen där kyrkattacken skedde.
Över 120 beväpnade grupper rör sig i de östra delarna av Kongo-Kinshasa. Många har sitt ursprung i krig och konflikter som härjade som värst i landet runt 2000-talet.