Branden som misstänks vara anlagd lämnade över 12 000 personer, de flesta av dem flyktingar från Afghanistan, Syrien och afrikanska länder, utan tak över huvudet.
Lägret som satts upp i Kara Tepe, norr om Mytilene, kan ta emot minst 5 000 människor, men många har varit motvilliga till att flytta dit då de snarare hoppas få lämna ön.
– Insatsen började med många poliser i vita dräkter, det gick lugnt till och migranter strömmar långsamt in i det nya lägret, säger ett vittne till Reuters.