Tillgreppet skedde natten mellan söndag och måndag och upptäcktes av personal vid åttatiden på morgonen.
– Okända gärningspersoner har tagit sig in på området genom att klättra över stängslet, säger Yvonne Sjöö vid Strängnäspolisen.
Bytet blev 26 växter av arten Tuja, som skulle ha kostat 1 000 kronor styck.
– Krukorna lämnades kvar. Växterna måste ha kastats över staketet, för det låg jord på andra sidan, berättar Yvonne Sjöö.
En av handelsträdgårdens ägare skriver på Facebook: "Tips mottas gärna".
"Detta är första gången vi drabbas av stöld av växter. Dessa är nog svåra att avsätta på marknaden, de bör ner i jorden omgående", summerar en av ägarna i ett sms till tidningen.